(1)秸稈的傳統利用價值在下降，新的利用價值還未被充分利用，而秸稈的收集翻曬即占地方，又浪費時間和勞動力。改革開放前，由于經濟能力較低或燃料不足，秸稈是我國農村家庭主要過冬燃料和牛羊等牲畜過冬的飼料。隨著經濟的快速發展，農民的生活水平有了顯著提高，作物秸稈作為農村傳統能源的地位逐漸被煤炭、天然氣等替代；同時加上農戶牲畜養殖量的減少，秸稈作為飼料的用量也逐漸下降。
農作物秸稈可以經過秸稈顆粒機、秸稈壓塊機壓制成生物質顆粒飼料燃料，可以完美的解決農作物秸稈的焚燒問題。
(2)機械化收割不規范，秸稈處置費時費力。目前，我國大部分小麥都采用機械化收割，聯合收割機多數跨區流動作業，非屬某一地區，管理較混亂。由于夏收時間緊，在經濟利益的驅使下，大多數聯合收割機主為了省時、省力和減少機器磨損，都將麥茬留的很高，一般在50-70cm，有的甚至只割掉麥穗。農民若采用其他處理方法，費時費力，干脆一燒了之。
(3)我國主要糧食產區如成都平原、珠三角地區和淮河流域，人均耕地少，復種指數高，雙季作物間隙時間段，遺留在地里的秸稈會嚴重影響耕作。我國各地氣候條件不同，北方降水量少，若將秸稈直接還田翻入地中，不易腐爛，對秸稈不進行處理，會影響耕種；南方麥田或油菜秸稈還田，夏種水稻季節，放水栽秧時秸稈會浮在水中，給插秧帶來不便。
(4)部分農民對秸稈焚燒的認識存在誤區。許多農民認為，焚燒后的秸稈殘渣留在地里作為肥料可以增加土壤中的無機肥含量，節約化肥投入量，而秸稈還田的技術開發和推廣仍然比較滯后。
(5)農村勞動力匱乏也是秸稈焚燒的重要原因。在市場經濟作用下，農村年輕勞力終年外出打工，留下務農的多是老弱病殘農民，缺少勞動力對秸稈進行處理。
